İçerisinde birçok madde bulundurma ihtimali olan yağmur suyunun kullanılması için filtrelenmesi ve dezenfekte edilmesi gerekmektedir. Filtreleme işlemi basit olarak filtre  ile olabilmektedir. Gelişmiş olarak ise su arıtma cihazları veya benzer filtreleme metotları kullanılabilir. Yağmur suyu toplanıp filtre edildikten sonra bahçe sulama, temizlik, araç yıkama, çamaşır makinesi, tuvalet rezervuarları gibi yerlerde kullanılabilir. Yağmur suyu filtreleri, geniş çatı alanları için uygundur. Filtre, yapı dışında depo veya bir kuyuya ya da doğrudan toprağa yerleştirilebilir. Filtreleme ve dezenfeksiyon işleminden sonra su kullanıla bilir, İki aşamalı temizleme sistemi sayesinde, kapsamı ne olursa olsun yüksek verimliliğe sahiptir. Filtre kartuşlu, manuel  yada otomatik olabilir